Q: 100G数据大约需要运行多久才能完成?MobiVision quantify有没有推荐线程数目?

针对不同的服务器配置及参数设置,100G数据运行时长并不完全相同。以Hygon C86 7285H 32-core Processor (2.5GHz)处理器为例:

1. 针对10G测序量的样本,增加线程数并不能显著降低分析时间,但会大大增加内存的使用量,因此10GB左右的文库推荐2-8线程;

2. 针对100G测序量的样本,当线程在24以下时,并不会显著增加内存的使用量,但可以显著减少分析时间;当线程设置在24以上时,内存使用量开始明显增加,因此100GB左右的文库推荐16-24线程;

3. 运行的时间和内存消耗与文库本身大小及设置的线程数有关,当文库大小达300GB时,我们建议分析时的内存不少于64GB。


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